لایحه خدمت اجباری نظام وظیفه هزینههای پنهانی دارد؛ آسیبهای اجتماعی، آسیبهای روانی فرد، هزینه فرصت نیروهای بهکار رفته، بالا رفتن سن ازدواج، خروج نخبگان از کشور و ادامه تحصیل بیرویه مشمولان سربازی در دانشگاهها برای عقب انداختن سربازی را میتوان بهعنوان هزینههای پنهان این قانون برشمرد.